CODA – Genomik & Transkriptomik
Genomik adalah kajian mengenai genom, iaitu set lengkap DNA dalam organisma. DNA mengekodkan gen yang mempunyai fungsinya sendiri. Penyelidikan mengenai genom membolehkan para penyelidik lebih memahami bagaimana gen berinteraksi antara satu sama lain dan variasi gen yang menyebabkan penyakit.
Pendekatan untuk mempelajari transkriptom, iaitu keseluruhan rangkaian transkrip RNA dalam suatu organisma dikenali sebagai Transkriptomik. Kajian transkriptom melibatkan semua yang berkaitan dengan RNA termasuk tahap ekspresi, pengaturan gen dan interaksi gen.
Metagenomik ialah kajian tentang struktur dan fungsi keseluruhan jujukan nukleotida daripada semua organisma (biasanya mikrob) dalam sampel pukal. Metagenomik sering digunakan untuk mengkaji komuniti mikroorganisma tertentu, seperti yang terdapat pada kulit manusia, dalam tanah atau dalam sampel air (National Human Genome Research Institute, NIH; https://www.genome.gov/genetics-glossary/Metagenomics).
Next Generation Sequencing (NGS) adalah teknologi penjujukan bertruput tinggi yang membolehkan penjujukan DNA dan RNA menggunakan pelbagai teknologi penjujukan moden. Contoh teknologi penjujukan moden ini merangkumi penjujukan Illumina, Ion Torrent dan 454. Teknologi yang lebih murah dan pantas ini membolehkan penyelidik melakukan kajian revolusi mengenai genomik dan transkriptomik.
CODA Genomik, Transkriptomik & Metagenomik menyediakan analisis data yang bermula dari pemprosesan data mentah, perhimpunan data (rujukan atau de novo), anotasi fungsi, analisis pengekspresan gen (DEG) bagi data transkriptomik, taxonomic profiling & visualization dan binning untuk data metagenomik serta pelbagai analisis fungsi yang lebih mendalam untuk membantu pengguna memahami biologi makna dari hasil ekspresi.
CARTA ALIR KAEDAH GENOMIK, TRANSKRIPTOMIK & METAGENOMIK
APA YANG KAMI TAWARKAN & PERINCIAN HARGA
| JENIS ANALISIS | CAJ |
| Analisis Genom / Transkriptom / Metagenom – Pemprosesan data jujukan mentah – Perhimpunan data (Rujukan / de novo) – Analisis Pengekspresan Gen (Transcriptome) – Taxanomic profiling & visualization (Metagenome) – Binning (Metagenome) – Analisis Anotasi Fungsi – Analisis yang lebih mendalam (Contoh : Analisis peramalan penanda molekul; SNP/SSR) | RM 200 / 5 Gbp data jujukan mentah |
PENCAPAIAN
PEGAWAI BERTANGGUNGJAWAB
Penyelaras Plot Penyelidikan / Felo Penyelidik
emelda@ukm.edu.my
Kultur Tisu Tumbuhan dan Genomik Berfungsi
Pegawai Sains / PIC Makmal Bioinformatik / Webmaster
+603 8921 4560
intanazlinda@ukm.edu.my